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高分辨率台式扫描电镜和透射电镜操作上的差异
这两种电子显微镜系统在操作方式上也有所不同。扫描电镜通常使用15kV以上的加速电压，天津生物样品电镜测试，而透射电镜可以将其设置在60-300kV的范围内。
与扫描电镜相比，透射电镜提供的放大倍数也相当高:透射电镜可以将样品放大5000万倍以上，而对于扫描电镜来说，限制在1-2百万倍之间。
然而，扫描电镜可以实现的视场(FOV)远大于透射电镜，用户可以只对样品的一小部分进行成像。同样，扫描电镜系统的景深也远高于透射电镜系统。
扫描电镜之电子探针的试样要求
具有较好的电导和热导性能
金属材料一般都有较好的导电和导热性能，而硅酸盐材料和其它非金属材料一般电导和热导都较差。后者在入射电子的轰击下将产生电荷积累，造成电子束不稳定，图像模糊，并经常放电使分析和图像观察无法进行。试样导热性差还会造成电子束轰击点的温度显著升高，往往使试样中某些低熔点组份挥发而影响定量分析准确度度。
电子束轰击试样时，只有0.5%左右的能量转变成X 射线， 其余能量大部份转换成热能，热能使试样轰击点温度升高，Castaing用如下公式表示温升△T(K):
式中V。(kV)为加速电压，i(μA)为探针电流，d(μm)为电子束直径，k 为材料热导率(Wcm-1k-1)。例如，对于典型金属(k=1 时)，当V。＝20kV，d＝1μm，i＝1μA 时，△T＝96K。 对于热导差的典型晶体，k=0.1，典型的有机化合物k=0.002。对于热导差的材料，如K=0.01， V0=30kV， i=0.1μA， d=1μm时， 由公式得ΔT=1440K。如果试样表面镀上10nm的铝膜，则ΔT减少到760K。因此， 对于硅酸盐等非金属材料必须在表面均匀喷镀一层20nm左右的碳膜、铝膜或金膜等来增加试样表面的导电和导热性能。
为什么扫描式电子显微镜看到的物像是无色的
扫描式电子显微镜下看到的物像是放大的虚像.光线通过反光镜到玻片，经过物镜，此时物距（玻片到物镜的距离）大于一倍的物镜焦距，小于两倍的物镜焦距，所以物镜会再镜筒里成一个玻片的放大的实像（相当于投影仪的原理），而这个像再通过目镜，此时物距（这个实像到目镜的距离）小于一倍的目镜焦距，所以在这个实像相对于目镜的同侧会成一个放大的虚像（相当于放大镜的原理），所以显微镜下看到的物像是放大的虚像.所以在扫描式电子显微镜下看到的物像是无色的。
这个问题想说清楚非常复杂，简言之就是扫描电镜成像使用的电子束波长不在人眼感知的范围内，已经超出了颜色所能表述的范畴。首先必须弄清楚什么叫“色”。通常来讲颜色是光通过人眼投射在锥状细胞上，经大脑处理过后形成的一种感知。人眼对不同波长的光会有不同的反应，在认知上就表现为不同的颜色。可以说颜色是人的主观感受，是大脑的产物，不是一种客观存在。
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