为什么不先对基因做预测,在预测的结果上直接做共定位?
不同的预测网站有不同的计算方法,同一个基因在不同的预测网站也可能得出不同的定位结果。另外所有的结果都应是基于实验得到的,对于不清楚可能定位在哪里的基因,一般推荐先做普通定位,根据普通定位的结果再决定做哪种细胞器的共定位。
适用于什么实验场景?
(1)基因功能研究,文章里总少不了这一项。
(2)研究蛋白相互作用,与酵母双杂实验结果相互验证。
1. 叶绿体
叶绿体是植物细胞中重要的细胞器之一,双分子荧光互补技术,它们负责进行光合作用,将光能转化为化学能。为了定位叶绿体,我们可以使用一种名为荧光素的化合物来标记它们。荧光素可以被叶绿体中的叶绿素吸收,从而发出绿色荧光。在洋葱细胞中,叶绿体通常位于细胞的边缘或周围。
2. 线粒体
线粒体是细胞中的另一个重要细胞器,它们负责产生细胞所需的能量。为了定位线粒体,我们可以使用一种名为MitoTracker的化合物来标记它们。MitoTracker可以穿过细胞膜并进入线粒体,从而发出红色荧光。在洋葱细胞中,线粒体通常位于细胞的中央或周围。
亚细胞结构分离定位法
通过离心等技术分离各亚细胞结构,然后从分离物种进一步提取蛋白质,对目标蛋白质进行分析或检测,从而获得目标蛋白的定位。本方法适合研究某蛋白质组级别的细胞器定位,通常与双向凝胶电泳分离和质谱技术相结合。
生物信息学预测
通过生物信息学手段,借助一些在线工具对蛋白的亚细胞定位信息进行预测,这种方法可以在短时间获得大量蛋白的预测信息,不仅辅助于实验,还能省时省力节约成本。
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