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原位杂交技术方法大致可分为:1.杂交前准备,包括固定、取材、玻片和组织的处理,如何增强核酸探针的穿透性、减低背景染色等;2.杂交;3.杂交后处理;4.显示(visualization):包括性自显影和非性标记的显色。固定原位杂交组织化学技术在固定剂的应用和选择上应兼顾到三个方面:保持细胞结构,限度地保持细胞内DNA或RNA的水平;使探针易于进入细胞或组织。DNA是比较稳定的,mRNA是相对稳定的但易为酶合成和降解。RNA却绝然不同,非常容易被降解。因此,对于DNA的定位来说,固定剂的种类和浓度并不十分重要。相反,在RNA的定位上,如果要使RNA的降解减少到低限度,那么,不仅固定剂的种类浓度和固定的时间十分重要,而且取材后应尽快予以冷冻或固定。

在ISHH,整个实验周期是比较长的,实验程序也比较繁杂,而杂交在ISHH整个实验中可被认为是“短兵相接”的一步。杂交前的一切准备工作如增加组织通透性都是为了在杂交这一步骤中核酸探针能进入细胞或组织与其内的靶核苷酸相结合。因此,杂交是ISHH中关键的而且是重要的一个环节。杂交是将杂交液滴于切片组织上,加盖硅化的盖玻片,防止孵育过程中的高温(50℃左右)导致杂交液的蒸发。为保证杂交所需的湿润环境,可将其放在盛有少量5×SSC或2×SSC(standard saline citrate, SSC)溶液的硬塑料盒中进行孵育。杂交液的成分和预杂交液基本相同,所不同的是加入了标记的核酸探针和硫酸葡聚糖。

荧光原位杂交(FISH)技术具有以下优点:

可多重染色:利用不同的荧光染料标记不同的探针,可以实现多重荧光原位杂交,GISH,从而同时检测多个序列,提高实验效率了。

高度创新性和性:FISH技术不仅可以用于研究已知基因或序列的染色体定位,还可以用于未基因或遗传标记及染色体畸变的研究,在基因定性、定量、整合、表达等方面的研究中颇具优势。

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