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如今，许多μ-CT系统都能达到分辨率低于1μm的范围内，体素尺寸低于0.1 μm。样品相对于光源和探测器的位置可以改变，以调整放大率和分辨率；但是，由于样品必须在视野内，因此位置总是样品大小和空间分辨率之间的折衷。
传统的μ-CT光源主要用于吸收模式，因为产生的光束不具有足够的相干性来获得相位衬度。
用于μ-CT系统的探测器照相机可根据其是否具有分辨X射线能量的能力分为两类。种情况是光谱 CT，由于单光子计数探测器取得的进步，近在μ-CT系统中引入了这项新技术。在大多数情况下，探测器只是对所有 X 射线能量进行积分。
小动物双能X射线技术是一种专门用于临床前小动物（如小鼠、大鼠等）的成像技术。它结合了双能X射线的原理，能够利用不同能量的X射线束来检测和分析小动物的骨骼、软组织等身体成分。
小动物双能X射线技术具有多种应用场景。首先，在骨骼疾病研究中，它可以地测量小动物的骨密度，评估骨骼质量，有助于研究骨质疏松、骨折愈合等疾病的发病机制。其次，在研发和评估中，双能x射线骨密度，小动物双能X射线技术可以监测对骨骼和身体成分的影响，为新药开发提供有力支持。此外，它还可以用于营养学研究和动物模型研究等领域，以了解不同饮食、营养补充或特定基因对小动物骨骼和身体发育的影响。
CT是种能够产生穿越人体横轴平面（切片）图像的方法，不会因不同解剖结构的叠加而产生偏差。从台临床CT扫描仪至今，涉及X射线源和新型探测器的巨大技术发展，使传输剂量和图像质量有了大幅改进。
CT 技术已经向更高分辨率的设备发展。X射线微断层扫描（μ-CT）系统能够对厘米大小的样品达到微米级空间分辨率，对1-2毫米大小的样品达到亚微米级空间分辨率（纳米断层扫描）。如今，从医学到生物学，从地质学到考古学和材料科学等广泛的研究领域都采用了这种技术。
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