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一般来说，μ-CT系统通常采用数字平面二维探测器；常用的是电荷耦合器件 (CCD)系统，该系统使用闪烁屏，通过光纤束耦合，将X射线转换为可见光子。
近，基于互补金属氧化物半导体（CMOS）技术的新型探测器问世，并应用于小动物体内成像系统。下表列出了分辨率和体素尺寸小于1 μm的亚微米和纳米CT系统。
限制X射线源亮度的一个问题是阳极的热负荷，它会导致阳极局部熔化。液态金属喷射阳极（MetalJet）技术的出现解决了这一问题，该技术通过高速喷射的薄液态金属取代了传统的阳极，从而克服了这一限制（图4）。
在这种情况下，阳极的熔化不再是问题，因为阳极已经熔化。使用这些系统获得的亮度比固体阳极X射线管高一个数量级，电子束功率密度可以高出十倍，并且可以获得足够的空间相干性，从而可以使用相位衬度成像技术。
基于分析器的技术（ABI）利用放置在样品和探测器之间的分析器晶体（图10）与单色准直X 射线光束相结合。样品根据折射率的实部δ对透射光束产生偏差（折射）。
晶体就像一个角带通过滤器，双能X射线，选择性地接受或拒绝这些光子。根据晶体的取向，只有符合布拉格衍射定律的窄角度范围的 X 射线才能传输到探测器并形成图像。因此，利用分析器晶体相对于主光束方向的不同方向，可以利用不同的折射效应，在X射线吸收之外提供额外的衬度。
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