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如今，许多μ-CT系统都能达到分辨率低于1μm的范围内，体素尺寸低于0.1 μm。样品相对于光源和探测器的位置可以改变，以调整放大率和分辨率；但是，由于样品必须在视野内，因此位置总是样品大小和空间分辨率之间的折衷。
传统的μ-CT光源主要用于吸收模式，因为产生的光束不具有足够的相干性来获得相位衬度。
用于μ-CT系统的探测器照相机可根据其是否具有分辨X射线能量的能力分为两类。种情况是光谱 CT，由于单光子计数探测器取得的进步，骨密度体成分分析，近在μ-CT系统中引入了这项新技术。在大多数情况下，探测器只是对所有 X 射线能量进行积分。
双能X射线动物身体成分分析具有多种优点。首先，它是一种非侵入性的检测方法，无需对动物进行任何预处理或手术，因此不会给动物带来痛苦或损伤。其次，测量速度快，可以在短时间内获得大量数据，适用于大规模的动物研究。此外，这种方法使用的辐射剂量相对较低，对动物的健康影响较小。
然而，双能X射线动物身体成分分析也存在一定的局限性。例如，它只能提供关于组织成分的数量信息，而无法提供关于组织结构和功能的信息。此外，不同动物的生理特点和组织成分可能存在差异，因此在使用该技术时需要根据具体情况进行调整和优化。
要描述图像的形成，必须从单个X射线光子的相互作用过程，到考虑到吸收和散射的X射线光束的定量衰减。一般来说，活体动物骨密度和身体成分分析，X射线成像背后的机制可以用样品的复折射率来解释。在宏观层面上，体成分分析，均质材料（即密度和原子序数Z一致）对单能量入射X射线光束的吸收可以用以下公式描述其中，I 为光束穿过物质后的强度，I0为入射强度；Δx为材料厚度。μ称为线性衰减系数，由光电效应、康普顿效应和相干散射效应的线性组合给出。
以上公式被称为比尔-朗伯定律。显然，肌肉含量体成分分析，μ值高物体比μ值低的物体更能衰减X射线。例如，在医学成像中，骨骼（高μ值）比软组织（低μ值）对X射线光子的衰减更大。在处理非均匀物体（即由多个具有不同吸收系数的较小均匀元素组成的物体）时，单个元素的入射强度由前一个元素的出射强度给出。将这一概念以级联的方式重复应用于每一个元素
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