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在啮齿动物中，BAT（Brown Adie Tissue，棕色脂肪）是一个新陈代谢组织。不同于白色脂肪，棕色脂肪因含有丰富的血管和大量的线粒体，而呈现棕红色的外观，可以在寒冷或饥饿环境下分解线粒体、为生物体提供能量。长久以来，棕色脂肪被认为只存在于小型哺乳动物和婴幼儿中，而近期的研究发现，棕色脂肪同样存在于成人体内，并在能量平衡调节方面发挥重要的功能。由此，MicroCT，棕色脂肪在能量代谢相关疾病如肥胖、Ⅱ型以及代谢紊乱等领域显示出巨大的应用潜能，关于棕色脂肪的功能和应用也迅速成为一个新的研究热点
像素 像素（pixel）是构成CT图像的小单位，与体素相对应，MicroCT胫骨，体素的大小在CT图像上的表现，即为像素。 信噪（signal/noise ratio，SNR）即信号和噪声的比值。任何一种信号中都会包含噪声，但信号和噪声之间的比值不同。在实际应用中，该比值越大，噪声的含量就越小，信息传递的质量就越高。
噪声 在CT中，噪声（noise）是一均匀物质扫描图像中各点之间CT值的随机波动，也可看作是图像矩阵中像素值由于各种原因引起的误差。
大密度投影 投影是把三维信息压缩到二维的常用方法.大密度投影（maximum intensity projection，MIP）将三维数据向任意方向进行投影，假想有许多投影线，取投影线经过的所有体素中大的一个体素值，作为投影结果图像的像素值.在投影线上取小值，就成为小密度投影。前者多用于显示高密度影，如血管造影，后者多显示低密度影，如气道。
心电门控的应用价值影像检查中，由于组织或脏器的运动（例如呼吸、心跳等）容易使得影像设备（包括超声、线CT以及MRI等）产生伪影，骨MicroCT，这会降低图像的分辨率及诊断价值。因而在心1血管和呼吸疾病研究中，控制好由于心脏或隔膜的运动而对 Micro CT 图像产生的影响，是至关重要的。
为了获得更好质量的影像，一般运用诸如呼吸补偿和呼吸门控、心电门控和心电触发等技术来做影像修正。所谓心电门控就是为了减少或消除心腔及心脏大血管的搏动对图像造成的影响而采取的基于硬件的门控技术手段。
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