DNA 探针为原位杂交提供较高的灵敏度。与RNA探针相比,DNA探针与靶mRNA 分子的杂交强度较弱,因此在杂交后的洗涤中不应使用甲醛。
探针特异性至关重要。如果已知细胞中mRNA或DNA的确切核苷酸序列,则可据此设计高度的互补探针。如果超过 5% 的碱基对不互补,那么探针只能与靶序列发生轻度杂交。这意味着,探针更容易在洗涤和检测步骤中被洗去,可能无法正确检测。
原位杂交杂交液
(一)杂交液内除含一定浓度的标记探针外,还含有较高浓度的盐类、甲酰胺、硫酸葡聚糖、牛白蛋白及载体DNA或RNA等。
(二)杂交液中含有较高浓度的Na+可使杂交率增加,可以减低探针与组织标本之间的静电结合。
(三)贾酰胺可使杂交温度降低,所以杂交液中加入适量的甲酰胺,植物原位杂交,可避免因杂交温度过高而引起的组织形态结构的破坏以及标本的脱落。
(四)硫酸葡聚糖能与水结合,从而减少杂交液的有效容积,提高探针有效浓度,以达到提高杂交率的目的。
生物领域应用原位杂交技术的例子:
基因表达和调控研究:原位杂交技术可以用于研究基因表达的调控机制。例如,原位杂交,可以标记特定基因的探针,检测该基因在不同环境、不同生长条件下的表达情况,原位杂交技术服务,进而研究其表达调控机制。
细胞分化与发育研究:在细胞分化与发育研究中,原位杂交技术常被用于检测和定位特定基因的表达情况,荧光原位杂交,进而了解细胞分化的过程和机制。例如,可以标记与细胞分化相关的基因探针,检测该基因在不同组织、不同发育阶段的表达情况。
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